YPK GBKP adalah unit pelayanan Pendidikan formal dan non formal yang difasilitasi oleh gereja untuk anak-anak jemaat dan masyarakat pada umumnya. Yayasan Pendidikan Kristen GBKP berdiri sejak tanggal 09 Januari 1982(09- 01-1982) Berdasarkan Akta Notaris No. 23 yang dibuat dihadapan Notaris Malem Ukur Sembiring, SH di Medan untuk jangka waktu yang tidak ditentukan.

Yayasan Pendidikan Kristen GBPK bertujuan :
a. Membantu Pemerintah dalam bidang mencerdaskan masyarakat serta berpartisipasi dalampembangunan bangsa dan negara, demi tercapainya tujuan negara yaitu  mewujudkan masyarakat adil dan makmur.
b. Mendirikan dan menjalankan Poliklinik-poliklinik dan pelayanan kesehatan.
c. Mendirikan dan menjalankan Pendidikan anak Usia Dini (PAUD) dan Taman Kanak-Kanak (TK)
d. Mendirikan dan menjalankan Sekolah Dasar (SD), Sekolah menengah Pertama (SMP), Sekolah Menengah Atas (SMA) dan Sekolah Menengah Kejuruan (SMK)
e. Mengadakan kursus-kursus keterampilan.
f. Mendirikan dan menjalankan Pusat Kegiatan Belajar Masyarakat (PKBM), Kejar Paket A, Kejar Paket B dan Kejar Paket C. 
g. Mendirikan dan menjalankan Pendidikan Tinggi (Universitas) Program Sarjana / Pasca Sarjana, Akademik, Program Diploma I, Program Diploma II dan Program Diploma III. 
h. Melaksanakan kegiatan lainnya yang dibutuhkan masyarakat sesuai dengan program yayasan sepanjang tidak bertentangan denganhukum dan peraturan pemerintah.

Struktur Kepengurusan:
Pembina               : Pdt. Krismas Imanta Barus, M.Th, LM
                               Pdt. Yunus Bangun, M.Th
Ketua                    : Prof. DR. Eva Marlina br Ginting, M.Si
Sekretaris             : Pdt. Oklin Yovalina Tarigan, S.Si (Theol)
Bendahara            : Nelly Sembiring, S.Pak
Divisi PAUD-TK    : Sumantri Tarigan, S.Kom (Koordinator)
                               Awen Luluina br Barus, S,Psi, Msi (Anggota)
                               Karmila br Karo S.Sos, M.Si (Anggota)
Divisi SD               : Pt. Rosmiati br Tarigan, S.Pd, M.Pd (Koordinator)
                                Buniks Rehulina br Sitepu, S.Pd, M.Pd (Anggota)
                                Rut Erlita br Tarigan, S.Pd (Anggota)
Divisi SMP            : Pt. Edi Suranta Sinulingga, SE, M.Si (Koordinator)
                                Golkar Sinulingga, SH (Anggota)
                                Selvi Oma br Barus, Amd (Anggota)
Divisi SMA/SMK    : Dk. Dra Julia Damaris Bukit, M.Pd (Koordinator)
                                Lidya Natalina Kaban, S.Pd (Anggota)
                                Irwan Ginting, S.Th, M.Pdk (Anggota)
Pengawas            : Pt. Em. Drs Kasman Sembiring
                               Pt. Dr. Dana Barus, SH, Sp.N, M.Kn